《报告》指出，黄岩岛珊瑚礁生态系统健康稳定，现场调查共记录造礁石珊瑚14科39属134种，较2024年调查多记录25种，活珊瑚平均覆盖度为29.8%，珊瑚幼体补充量较高，珊瑚群落对海水温度升高具有较好的抵抗力和耐受性；礁栖生物多样性丰富，现场调查记录到礁栖鱼类24科145种，较2024年调查多记录20种；此外还记录到砗磲3种，以及壳状珊瑚藻、苍珊瑚、软珊瑚、海百合等；未发现珊瑚向大型藻类的相变，未发现珊瑚礁病害现象，长棘海星等敌害生物数量少。现场调查还记录到黄岩岛潟湖内分布着3种海草，分别为卵叶喜盐草、圆叶丝粉草和针叶草。
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